В это же время происходило массовое закрытие церквей. В 1929 г. закрыли Архангельский Троицкий кафедральный собор. В Сурской волости каменный Успенский собор Иоанна-Богословскго женского монастыря был превращен в кинотеатр, колокольня стала пожарной каланчой, часовню в деревне Лавела разобрали на дрова.
В сознании большинства крестьян гонения на Церковь воспринимались в соответствии с традиционными религиозно-нравственными нормами, и такое тяжелейшее преступление, как разрушение храма, естественно, вызывало негодование. По народному мнению, содеянное обязательно навлекало на разрушителей кару Божью, «за такой грех Бог долгой жизни не даст»11. По воспоминаниям жителей д. Ваймуша Пинежского р-на, «колокольню и церковь в Ваймуше разобрали, когда партийцы пошли, все разворотили. Да, сначала крест снимали, потом колокола сняли, а потом и всю разобрали. Иконы, это ясно, что растащили. А партийцам потом худо было. Все и умерли. Народ говорит, умерли».
В начале XX в. в Архангельской губернии действовали более 30 монастырей, скитов, пустыней. Специального декрета об упразднении монастырей в Советской России не было принято, и закрытием считалось расторжение договора между органами местной власти и коллективом верующих об использовании последними церковных зданий. Одним из первых пострадал Соловецкий монастырь. В 1920 г. здания упраздненного Пертоминского монастыря было решено использовать под трудовую колонию для дефективных детей. В том же году в Антониево-Сийском монастыре была основана трудовая коммуна. В 1921 г. упразднен Сурский и колокола, зовущие женский и другие монастыри.
Закрытие обителей сопровождалось изъятием ценностей, которое, как известно, проводилось со многими нарушениями. Участники Северной экспедиции музейного отдела Наркомпроса (И. Грабарь, Н. Померанцев и др.) признали, что хуже, чем в Архангельской губернии, музейное дело и охрана памятников старины не обстоят нигде. Еще в 1918 г. началась кампания по вскрытию мощей, хранящихся в монастырях. К середине 1920-х гг. были вскрыты мощи почти всех северных святых.